Le 20 juin 2016, le Conseil a autorisé, au nom de l'UE, la signature et l'application provisoire de l'accord de partenariat économique (APE) entre l'UE et la Communauté de l'Afrique de l'Est (CAE). La Communauté de l'Afrique de l'Est comprend le Burundi, le Kenya, l'Ouganda, le Rwanda et la Tanzanie.
Les accords de partenariat économique visent à renforcer l'intégration régionale et le développement économique dans les pays d'Afrique, des Caraïbes et du Pacifique (les pays dits ACP). Ces accords reposent sur le principe d'une ouverture asymétrique des marchés, c'est-à-dire qu'ils assurent un meilleur accès au marché de l'UE pour les pays ACP partenaires. Ils offrent notamment des débouchés commerciaux inédits pour les produits agricoles et les produits de la pêche. Les APE remplacent le système précédent d'accès au marché consistant en préférences unilatérales pour les pays ACP.