El Consejo es asistido por el Comité de Representantes Permanentes de los Gobiernos de los Estados miembros de la Unión Europea (Coreper) y por más de 150 grupos de trabajo y comités altamente especializados, denominados «órganos preparatorios del Consejo».
Los órganos preparatorios pueden dividirse en dos categorías principales:
- Comités creados por los Tratados, por decisión intergubernamental o por un acto del Consejo: en la mayoría de los casos son órganos permanentes y su presidente suele ser nombrado o electo.
- Comités y grupos de trabajo creados por el Coreper: se ocupan de asuntos muy concretos y su presidente es el delegado del país que ejerce la presidencia rotatoria semestral del Consejo.
Además, pueden crearse para fines específicos comités ad hoc que desaparecen una vez cumplido su cometido.
- Ad hoc Working Party on Article 50
- Comité de Asuntos Culturales
- Comité de Coordinación de los Sistemas de Información y Comunicaciones (CCSIC)
- Comité de Coordinación en el ámbito de la Cooperación Policial y Judicial en Materia Penal (CATS)
- Comité de Educación
- Comité de Empleo
- Comité de Política Comercial
- Comité de Política Económica (CPE)
- Comité de Protección Social (CPS)
- Comité de Seguridad
- Comité de Servicios Financieros (CSF)
- Comité del Espacio Europeo de Investigación e Innovación (CEEI)
- Comité Económico y Financiero
- Comité Especial de Agricultura (CEA)
- Comité Estratégico de Inmigración, Fronteras y Asilo (CEIFA)
- Comité Militar de la Unión Europea (CMUE)
- Comité para los aspectos civiles de la gestión de crisis (COMCIV)
- Comité Permanente de Cooperación Operativa en materia de Seguridad Interior (COSI)
- Comité Político y de Seguridad (CPS)
- Comité Presupuestario